Генеральный консул Туркменистана в Мешхеде /Иран/ (до июля 2001).
С июля 2001 - Заместитель министра иностранных дел, директор Национального института демократии и прав человека при президенте Туркменистана с испытательным сроком в 6 месяцев.

Указом С.Ниязова от 18 июня 2002 "за допущенные серьезные недостатки в работе и грубые нарушения действующего законодательства лишить Худайкулиева Батыра Оразкулиевича воинского звания майора, материальных и иных льгот, установленных действующим законодательством для военнослужащих, а также государственных наград и уволить его с военной службы". Одновременно, но уже "Постановлением Президента Туркменистана Худайкулиев Батыр Оразкулиевич освобожден от обязанностей заместителя министра иностранных дел Туркменистана за серьезные недостатки в работе". ("Нейтральный Туркменистан", №149 за 19 июня 2002).