Родился на станции Федченко в Ферганской области в семье железнодорожника. Узбек.
После окончания железнодорожного техникума работал на железной дороге.
В 1956 г. заочно окончил исторический факультет Киргизского университета. После этого работал в Джамбуле в обществе "Знание".
В 1964 г. вступил в КПСС.
В 1967 г. переехал в Ташкент. Работал в Главлите, Госкомпечати, заведовал кафедрой в Высшей партийной школе.
В 1975 г. защитил диссертацию кандидата исторических наук, а в 1987 г. - докторскую диссертацию.
Тема последней: "Деятельность компартии Узбекистана по развитию творческой активности рабочего класса промышленности (60 - 80 - е гг.)".
C 1991 г. руководит научным коллективом, изучающим вопросы истории периода перестройки, в Институте истории АН Узбекистана. Летом 1991 г., незадолго до путча, вышел из КПСС.
В сентябре 1991 г. выступил инициатором создания Движения демократических реформ в Узбекистане.
На учредительном съезде в декабре 1991 г. избран председателем ДДР.
В марте 1992 г. избран сопредседателем Межреспубликанского ДДР Движение, однако, не обрело в республике заметного влияния даже в оппозиционных кругах.
Летом 1992 г., убедившись в бесперспективности ДДР в Узбекистане, Исхаков попытался создать Партию социального прогресса. Но эта попытка также не увенчалась успехом. По взглядам считает себя лево - центристом, близким к социал - демократам.