Родился в г. Кулябе. Известен также по кличке "Седой".

Окончил Таджикский институт физкультуры (1978), Республиканскую Высшую школу милиции (1995), по специальности "юрист-правовед" и курсы в одной из Военных академий РФ (2003).

С 1978 - учитель физкультуры в средней школе, преподаватель физкультуры в Кулябском педагогическом институте.
В 1982-85 - проректор по хозчасти ТИФК.
В середине 1980-х был осужден.
С 1985 - водитель дальних рейсов Кулябского автотранспортного предприятия.
В 1989-91 - председатель профсоюза работников АПК Кулябской области.
С 1991 - зам. командира по личному составу 1-й Специальной бригады при МВД РТ.
С января 1993-январь 1995 - командир бригады.
С 1995 - 26 января 2004 г. - командир Президентской гвардии РТ (сформирована на базе 1-й бригады МВД). 26 января 2004 г. освобожден от должности в "связи с преобразованием Президентской Гвардии РТ в Национальную гвардию РТ". Публично заявил российскому "Интерфаксу", - "Перед этой отставкой со мной никто не советовался. Я не согласен с этим решением и считаю этот указ неправильным". Добавил, что около 200 офицеров-гвардейцев подали рапорты об увольнении.

В 1995-2000 - народный депутат Маджлиси Оли от 53-го Тоджикободского округа - член Комитета по по правопорядку, обороне и безопасности.
Летом 1997 - Руководитель операции по разгрому "незаконных вооруженных формирований" (сторонники Якуба Салимова, М.Худойбердыева и "отряды местной самообороны") на западе страны (войска в августе 1997 г. взяли Гиссар, Шахринау, Таджикский алюминиевый завод).
С 30 января по 5 августа 2004 - председатель Агентства по контролю за наркотиками при Президенте РТ.

Президент Национального Олимпийского комитета (=2001=). Переизбран на этот пост на безальтернативных выборах 30 июля 2004 г.

Генерал-лейтенант (июнь 1999).

Женат. Четверо детей.

"По слухам, является крупным бизнесменом, владельцем индустрии развлечений. Сам Мирзоев отрицает свою причастность к предпринимательству". ("Независимая газета", №15 за 28.01.2004).

Арестован утром 6 августа 2004 г. в Душанбе. Разоружен вместе с 7 охранниками, сопротивления не оказал. "Подозревается в убийстве госчиновника, незаконном хранении большой партии оружия, незаконном предпринимательстве, захвате земли и других преступлениях". данным генпрокуратуры Таджикистана, генерала подозревают в том, что в 1998 году он из табельного пистолета застрелил в своем служебном кабинете начальника УВД Шахринавского района Мирзо Абдулоева, а потом выдал это преступление за самоубийство. Также, по версии следствия, г-н Мирзоев заключил контракт от имени правительства Таджикистана на использование в Афганистане государственного вертолета, а сам отправил туда свой личный вертолет и положил себе в карман выручку в 600 тыс. долл. Еще Мирзоеву инкриминируется присвоение 350 гектаров земли и незаконное хранение целого арсенала оружия. В одном из помещений агентства полиция обнаружила 3 тыс. единиц стрелкового оружия, 300 мин, а на территории принадлежащей генералу фирмы "Мирзоирох" оказалась установка "Стингер", закрепленная на машине "Тойота".

По данным российской газеты "Время новостей" (10.08.2004) - "Его фамилия фигурирует как минимум в двух расследованиях - в отношении банды братьев Челышевых, подозревавшихся в самых громких заказных убийствах последнего времени Фамилия Мирзоева фигурировала в расследовании дела банды братьев Сергея и Андрея Челышевых. Их вместе с авторитетами Сергеем Поповым (Серый) и Сергеем Яковлевым (Фандора) подозревали в совершении ряда убийств, в том числе Владислава Листьева и вице-мэра Санкт-Петербурга Михаила Маневича. Когда в 1998 году сотрудники МВД РФ вышли на след банды, большинство ее участников сумело скрыться. По версии оперативников, Фандора хорошо был знаком с Гафуром Мирзоевым, поэтому именно к нему и отправились киллеры. Вначале они жили в усадьбе Седого в столице Таджикистана, а потом переехали в его загородную резиденцию. Милиционерам удалось установить, что все это время авторитеты вели с Мирзоевым переговоры о налаживании поставок героина в Россию. В знак успешного сотрудничества они даже подарили Седому автомобиль "Фольксваген", на котором прибыли в Таджикистан. Вскоре о месте, где скрывались бандиты, узнали российские оперативники, и на территорию расквартированной в Таджикистане 201-й дивизии прибыла группа захвата. Узнав об этом, Мирзоев сразу выпроводил ненужных гостей в Узбекистан. Позже их арестовали в Киргизии.
и в отношении ряда жителей Таджикистана, организовавших поставку в Россию 340 кг героина - .Летом прошлого года сотрудники ФСБ РФ получили информацию, что из Таджикистана к нам следует грузовик, в котором спрятана партия героина общим весом 341 кг. За всеми, кто стоял за этой поставкой, было установлено наблюдение, а их телефоны поставили на прослушивание. В результате машина добралась до Нижнего Новгорода, где дельцы стали обсуждать, что дальше делать с товаром. Контролировал всю их деятельность некий Фарход, у которого, в свою очередь, был еще более высокопоставленный босс. Кто этот босс, удалось выяснить после прослушивания телефонного разговора Фархода. Сразу после прибытия грузовика в Нижний Новгород Фарходу позвонил человек по имени Гафур и поинтересовался: "Где собираетесь выгружать товар?" Позже ФСБ установило, что звонившим был не кто иной, как Гафур Мирзоев, находившийся в тот период в Москве. Из-за государственного масштаба деятельности Седого ни в 1998 году, ни прошлым летом он был недоступен для российских спецслужб".

Владел крупным казино в Душанбе.

24 декабря 2004 - выступая перед сотрудниками правоохранительных ведомств Э.Рахмонов сказал, - "Доказано, что фирма "Мирзо Рахмон", руководителями, которой являлись бывший командир национальной гвардии Гаффор Мирзоев и его брат Абдурасул Мирзоев, в последние годы занималась вовлечением несовершеннолетних девушек в проституцию".

13 августа 2006 г. Верховным судом Таджикистана приговорен к пожизненному заключению.