Сейед Мохаммад Хатами родился в 1943 году в семье священнослужителя в городе Ардакан провинции Йезд. Эта провинция остается в Иране центром зороастризма, или огнепоклонничества, - верования, господствовавшего в Персии в доисламские времена.

Отец Хатами - Рухолла Хатами был известным в округе исламским теологом и прославился тем, что создал ассоциацию, которая объявила "крестовый поход" против нарушения норм шариата. Аятолла Хомейни уже после революции 1979 года высоко оценил заслуги отца нынешнего президента.

В 1961 году Мохаммад Хатами с отличием окончил общеобразовательную школу и отправился в Кум - религиозный центр - постигать высшие премудрости богословия. Через несколько лет продолжил обучение на философском факультете Исфаганского университета.

В 1970 году, уже имея религиозный титул ходжат-оль-ислама, Хатами поступил в Тегеранский университет. Окончив его, отправился в Кум для получения звания муджтахида (высшего толкователя Корана и законов шариата). Оно присваивается наиболее видным священнослужителями и дает право участвовать в вынесении иджтихада - обязательного для исполнения всеми членами шиитской общины заключения высшего духовенства по основным вопросам религии и бытия.

В 1974 году Хатами женился. В настоящее время он - отец двух дочерей и сына.

Политическую деятельность Хатами начал еще в 1962 году в Куме, где в то время разворачивалась религиозно-политическая борьба имама Хомейни. Будучи талибом (учащимся) семинарии, он вступил в Исламскую студенческую ассоциацию. В середине 60-х годов САВАК (тайная политическая полиция) устроила повальные аресты. Попал в тюрьму и Хатами, однако, вскоре его выпустили на свободу.

Из-за репрессий властей Хатами в конце концов был вынужден покинуть Иран. По настоянию аятоллы Бехеши он отправился в Гамбург, где стал главой исламского центра. После победы исламской революции в 1979 году Хатами возвратился в Иран, а в 1980 году был избран депутатом меджлиса первого созыва от избирательного округа его родного города Ардакана. Одновременно он занимался издательской деятельностью. Был руководителем издательского дома "Кейхан".

В 1982 году Хатами стал членом правительства. В кабинете премьер-министра Хосейна Мусави он получил портфель министра культуры и исламской ориентации. Эту должность он сохранял и в команде четвертого президента ИРИ Хашеми-Рафсанджани, преемником которого ему суждено было стать.

В мае 1997 года Сейед Мохаммад Хатами, набрав более 70 процентов голосов избирателей, победил на президентских выборах и стал пятым президентом страны. Возможно его триумфу способствовал титул "сейед", означающий принадлежность к потомкам пророка Мохаммада, но, скорее, сыграли роль его предвыборные обещания перемен, которые ныне в Иране очевидны. Сейчас позиции президента представляются более чем прочными. Хатами опирался главным образом на молодежь и женщин, которым во во время президентской гонки сулил больше свобод и привелегий. И свои обещания он сдержал.

В июле 2001 года Сейед Мохаммад Хатами избран президентом на второй 4-х летний срок.

От президента в Иране не все зависит: он лишь второе лицо в государстве. Неограниченная власть фактически принадлежит духовному лидеру, в настоящее время аятолле Али Хаменеи.

Нынешний президент Ирана свободно владеет арабским, английским и немецким языками. Ему принадлежит несколько десятков научных трудов, в том числе и по теологии, политэкономии, социологии.