Место рождения - Наманган, Узбекистан
Окончил ПТУ № 28 города Намангана
В ноябре 1987 г. был призван на армейскую службу в воздушно-десантные войска.
В 1988 г. воевал в Афганистане.
В 1989 г. вернулся на родину и вошел в контакт с исламскими деятелями. Принимал активное участие в создании исламской организации "Товба" ("Покаяние"), занимавшегося изучением и пропагандой ислама.
В 1991 г. он установил тесные контакты с наиболее радикально настроенными лидерами Партии исламского возрождения Таджикистана (ПИВТ).
В 1992 году перебрался в Афганистан, где попал в тренировочный лагерь таджикской оппозиции.
В 1993 г. был командирован на восток Афганистана в специальный лагерь "Бадер-2".
После встречи в мае 1993-го с одним из заместителей шефа саудовской Службы общей разведки, был переведен в тренировочный лагерь "Мирам Шах".
Вернувшись летом 1993 г. из Афганистана, Намангани на средства исламистских организаций (главным образом "Ихван аль-Муслимун", "Хизб ут-Тахрир аль-ислами" и саудовского фонда "Ибраим бин-Абдулазиз Ибраим") основал в Таджикистане собственный лагерь.
В дальнейшем он создал на севере Таджикистана целую сеть военных и тренировочных лагерей.
Отряд под командованием Ходжиева принимал активное участие в гражданской войне на стороне Объединенной таджикской оппозиции (ОТО).
В 1996 г. выехал в Саудовскую Аравию, где прошел спецкурс в одном из религиозных центров, действующем под непосредственным контролем саудовской Службы общей разведки.
В 1997 г. Ходжиев стал "главнокомандующим вооруженных сил ИДУ".
Основные базы Ходжиева находятся в Ясманском ущелье Джиргатальского р-на и селении Хоит Таджикабадского р-на (около 50 км от кыргызско-таджикской границы).
В ноябре 2000 года Верховный суд Узбекистана заочно вынес смертный приговор Джуме Намангани, признав его виновным в терроризме, покушении на президента Каримова и разжигании национальной и расовой розни.
Женат. Имеет сына