Окончил Волжское высшее военное училище (1988) по специальности инженер-экономист. Окончил Академию Федеральной пограничной службы Российской Федерации (1994-97).

После окончания училища служил в Группе Советских войск в Германии, затем остался служить в Вооруженных силах Российской Федерации.
В 1993 году вернулся на Туркменистан, где поступил на службу в отдел материально-технического снабжения Управления погранвойск Туркменистана. В 1994 году был направлен на учебу в российскую академию. По окончании учебы, с 1997 года продолжил службу в Туркменистане.
Нач-к оперативного отдела Государственной Пограничной службы (до ноября 2003).
В 28 ноября 2003 - 17 мая 2004 - Командующий Государственной Пограничной службой Туркменистана.

17 мая 2004 - освобожден от должности "в связи с переходом на другую работу". Выступая в этот день на расширенном заседании Кабинета министров Туркменистана, Ниязов заявил собравшимся что 36-летний А. Атджанов сам попросил освободить его от занимаемой должности по состоянию здоровья, выраженному в повышенном кровяном давлении.
На какую "другую" работу переходит А. Атджанов, Ниязов не сообщил, отметив, что он "не имеет к контрабанде нефтепродуктов никакого отношения". Одновременно - освобожден от должности за контрабанду нефти в Узбекистан директор Сейдинского НПЗ Какаджан Чарыев.