Род. в уезде Баграм провинции Парван.

Окончил Кабульскую военную академию и стажировался в СССР.

Был членом Народно-демократической партии Афганистана, фракция "Парчам/Знамя" и кандидатом в члены ЦК НДПА.

В конце 1970-х - адьютант президента Дауда. В 1977 сопровождал его во время визита в СССР.
После "саурской" революции 1978 - и.о. начальник Генерального штаба.
В январе 1980-январе 1984 - начальник Генерального штаба.

Был ключевой фигурой при подавлении попытки госпереворота "Шахнавоз Танай – Гульбетдин Хекматияр" в 1990 году. Наджиб подавил мятеж при помощи Ахмадшаха Масуда и после падения режима Наджиба, Бабаджан присоединился к силам Масуда. Во время войны Северного Альянса с формирования Талибан, Бабадан командовал подразделением, контролировавшим стратегически важный аэродром Баграм.

В период борьбы с "Талибаном" генерал Бабаджан руководил северным фронтом под командованием Масуда. Во время 14-летнего правления Хамида Карзая командовал силами безопасности Герата, Кабула и Бадахшана, а также дважды занимал пост начальника полиции северных провинций.

При правительстве Хамида Карзая сначала возглавлял полицию Кабула, но имел трения с тогдашним министром внутренних дел Саидом Ахмадом Джалали и Карзаем и был смещен с должности.

С авг. 2014 - нач-к полиции провинции Бадахшан

Главнокомандующий Сил полиции Северных провинций ИРА (=2016=)

Генерал-майор (с конца 1970-х).