Род. в г. Каратау, Джамбульская область, КазССР. Родители - врачи. Отец, Василий Тимофеевич - психиатр, возглавлял в Таразе психдиспансер, работал заместителем заведующего Джамбулским облздравотделом, мать - Елизавета Рахимовна, нарколог, работала фельдшером

профессия - врач-психиатр,

Первый научно-фантастический рассказ "Нарушение" был опубликован в журнале "Заря" (Алма-Ата, 1988)
Начав с вещей, в которых сильно чувствовалось подражание Крапивину (из наших), Хайнлайну (из зарубежных) достаточно быстро перешел к творчеству в собственном оригинальном стиле.
Известность писателю принесли повести "Рыцари сорока островов", и "Атомный сон". Первая НФ публикация - "Нарушение" ("Заря" (Алма-Ата), 1988). Также у автора можно выделить трилогию "Линия Грез" - "Императоры Иллюзий" - "Тени снов", как весьма и весьма нетрадиционную космическую оперу, для которой определили жанр "философско-космическая опера", трилогии "Сегодня, мама!" и "Лорд с планеты Земля". Начиная с 1997 года, все более-менее значимые произведения стали доступны в виде книг (смотри библиографию).
Говоря о произведениях Лукьяненко, нельзя не отметить "Лабиринт отражений", ставший культовой книгой в русском Интернете. (Только с этой страницы ее скачало более 100 000 человек).
Свой жанр писатель определяет как "Фантастику жесткого действия" или "Фантастику Пути".
Помимо большого числа других литературных премий, в 1999 году Сергей Лукьяненко стал самым молодым на нынешний день лауреатом "Аэлиты" - старейшей отечественной премии, присуждаемой за общий вклад в развитие фантастики.
Сергей женат, постоянно проживает в Москве. Воспитывает сына. Держит домашних животных (декоративных мышей и йоркширского терьера Бусю), увлекается кулинарией и курит любимую трубку.

В феврале 2022 года подписал "Обращение писателей России по поводу специальной операции нашей армии в Донбассе и на территории Украины" в поддержку ввода войск России на Украину

Лауреат премий:
"Аэлита" (1999) - самый молодой автор, удостоенный премии за вклад в развитие отечественной фантастики[12].
"Звездный мост" (1999-2004, 2009)
"Бронзовая Улитка" и "Интерпресскон" в номинации "крупная форма" за роман "Спектр" (М.: АСТ, 2002)[13]
"EuroCon" (2003)
Платиновый Тарлан (2005)
"Corine" (2007)
премии имени Александра Грина (2010)[14].
Многократный лауреат премии "Странник" в различных номинациях.

Супруга, София Анатольевна Лукьяненко (ур. Косиченко), родилась в Алма-Ате в 1969 году, окончила психологический факультет Казахского государственного университета по специальности "детский психолог, преподаватель психологии", работала по специальности больше 10 лет, до декабря 2003 года. Преподавала психологию в Казахском университете, затем в Российском государственном гуманитарном университете на факультете психологии имени Выготского. Защитила кандидатскую диссертацию.
Деьт: Артемий (род. 24.02.2004),
Даниил (род. 23.11.2007),
Надежда (род. 29.11.2012)