Родился в с.Предгорное Глубоковского района Восточно-Казахстанской области. Отец - Вячеслав Алексеевич, инвалид ВОВ, потерял руку, участник боев в Сталинграде и на Курской дуге. Мать - Анастасия Николаевна. В семье еще 2 брата (Геннадий и Евгений) и 3 сестры (Анна, Наталья и Ирина).

Окончил Усть-Каменогорский индустриальный техникум (1970 г.), Алма-Атинский энергетический институт (1977 г.), АВПШ (1990 г.), техник-теплотехник, инженер-электрик, доктор экономических наук.

В юности работал пастухом и с 14 лет - подсобным рабочим в студенческих стройотрядах.
После окончания техникума работал дежурным слесарем, слесарем по ремонту, сменным мастером, мастером, старшим инженером-технологом ПТО, заместителем начальника котельного цеха, начальником турбинного цеха Алма-Атинской ТЭЦ (1970-85 гг.); главным инженером Алма-Атинского предприятия тепловых сетей (1985-86 гг.); председателем Ленинского райисполкома (1986-89 гг.); вторым секретарем Алма-Атинского горкома партии (1989-91 гг.); первым заместителем председателя Алма-Атинского горсовета - председателем горисполкома (март 1991 г. - февраль 1992 г.); первым заместителем главы Алма-Атинской городской администрации (февраль 1992 г. - март 1995 г.); министром энергетики и угольной промышленности РК (март 1995 г. - март 1997 г.); министром энергетики и природных ресурсов РК (март - июнь 1997 г.); с июня 1997 г. по 9 декабря 2004 - аким города Алматы.
9 декабря 2004 - 11 янв. 2007 - аким Восточно-Казахстанской области.
С 11 янв. по 1 ноября 2007 - министр по чрезвычайным ситуациям РК;

В начале 2008 г. выехал из Казахстана в Швейцарию, где по сообщению ряда СМИ "имеет бизнес".

Уголовное дело в отношении В. Храпунова было возбуждено Казпрокуратурой 22 ноября 2011 года по фактам совершения ряда коррупционных и экономических преступлений. В качестве меры пресечения суд санкционировал его арест. 8 февраля 2012 года правоохранительные органы РК инициировали межгосударственный розыск фигуранта. В. Храпунов вместе с семьей проживает в швейцарском кантоне Вале, в котором расположен город Женева.

Хобби - бокс, волейбол. Кандидат в мастера спорта по боксу.
Почетный президент Федерации хоккея с шайбой РК (до авг. 2008).
Член совета попечителей КИМЭП при Президенте Республики Казахстан. Член совета директоров ЗАО "Банк развития Казахстана".

По данным на начало 2010 г. входит в десятку богатейших людей Швейцарии.
В 10.2012 подал прошение о предоставлении политического убежища в Швейцарии.
По оценкам журнала Bilanz на 10.2012 состояние семьи Храпуновых составляет от 300 до 400 миллионов франков.

8 октября 2018 г. Алматинским судом приговорен к 17 годам лишения свободы с отбыванием наказания в учреждении максимальной безопасности, с конфискацией имущества, с лишением права занимать должности в Национальном банке, финансовых учреждениях, в государственных организациях и других учреждениях. Одновременно, его жена Лейла Бекетова осуждена на 14 лет.

Женат. Жена - Л.К.Бекетова. Всего 5 детей и 7 внуков. Сын Ильяс (1984 г.р., с 14 лет живет в Швейцарии, с 09.2007 - женат на дочери банкира М.Аблязова Мадине, Закончил Вебстерский университет Женевы, с 2007 г. - директор компании Swiss Development Group SA, Швейцария - строительство гостиниц и ВИП- резиденций в Валэ и кантоне Вод. Внучка Аделя.
Дочь Эльвира Храпунова-Бельдимани (1980) входит в число 300 самых богатых жителей Швейцарии, гражданка Швейцарии, возглавляет Swiss Development Group.

Всего трое детей и три внука.