Родился в селе Кызылункур Ленинского района Ошской области. Кыргыз.

образование высшее, окончил в 1971 году Фрунзенский политехнический институт (ФПИ), энергетический факультет, и был оставлен как один из лучших выпускников института на кафедре "Электропривод и автоматизация промышленных установок".

В 1973 году поступил в аспирантуру Московского энергетического института, успешно завершил ее в 1976 году досрочно защитив кандидатскую диссертацию. После окончания аспирантуры продолжил научно-педагогическую деятельность в ФПИ. Опубликовал 16 научно-методических и научных трудов и 1 изобретение.

Э.А. Байсалов свою трудовую деятельность начал в 1971 году после окончания ФПИ.

В 1979 году был избран председателем профсоюзного комитета политехнического института и проработал до 1984 года.

В 1979-1984 гг. избирался членом республиканского комитета профсоюза работников высшей школы, научных учреждений и, являясь председателем профкома ФПИ, внес большой вклад в улучшение жилищно-бытовых условий, в развитие санатория-профилактория, оздоровительно-спортивного лагеря для студентов. Три раза в течении 5 лет избирался членом плениума Республиканского комитета профсоюза работников ВШ, НУ и просвещения. Избирался кандидатом в члены Центральногокомитета профсоюза работников ВШ, НУ и просвещения.

С 1984-1990 гг. работал деканом по работе с иностранными студентами. Одним из первых в стране внедрил контрактную форму обучения иностранных студентов, улучшив бюджет института.

Являясь с 1990 года проректором по международным связям, расширил связи ФПИ с зарубежными странами. Были заключены долгосрочные договоры на подготовку инженерных кадров для республик Индия и Сирия.

В начале 90-х годов с приобретением независимости Кыргызской Республикой и переходом к рыночной экономике, начал разработку и внедрение в производство передовых новых технологий.

В 1996 году организовал предприятие по производству базальтового волокна по новой технологии, разработанной совместно с российскими учеными.

В 1978 году за активное участие в решении социально-экономических проблем Жумгальского района Байсалову Э.А. было присвоено звание "Жумгал районунун ардактуу атуулу".

В феврале 2005-10.2007 - депутат Жогорку Кенеша по Жумгал-Акталинскому округу № 35. Член фракции "Жибек-Жолу".

В декабре 2007 года баллотировался в депутаты парламента IV созыва от партии "Ата-Мекен". Партия проиграла, не преодолев 0,5-процентный региональный барьер.

Вошел в список 100 самых богатых людей Кыргызстана по версии газеты "De-Факто".

До янв. 2009 - член политсовета оппозиционной партии "Ак-Шумкар".

генеральный директор ОсОО "Вулкан" (=2010=)

В авг. 2010 выдвинут под №60 партийного списка партии "Ата Мекен" на парламентских выборах.

Государственный советник государственной службы II класса.