Внук Эшон Бабахана ибн Абдулмажидхана, сын Зияуддинхана ибн Эшон Бабахана после смерти своего отца в 1982-1989 годах возглавлял Духовное управление мусульман Средней Азии и Казахстана (САДУМ). Высокообразованный человек, кандидат филологических наук, свободно владеющий несколькими языками, профессиональный арабист, дипломат. В 1966 году окончил университет "Аль-Азхар" в городе Каире. В 1966-1974 годах старший референт Отдела мусульманских организаций СССР по внешним связям. В 1974-1982 годах возглавлял Ташкентский исламский институт имени Имама аль-Бухари сначала как проректор, а затем как ректор. В 1985 году избран действительным членом королевской Академии Иордании. В 1982-1990 годах Председатель Отдела мусульманских организаций СССР по международным связям. Как представитель мусульман СССР он входил в организационный комитет важных международных конференций и был их участником. На этих форумах в своих многочисленных выступлениях он призывал всех укреплять мир и дружбу между народами, бороться против религиозного экстремизма и фанатизма, соблюдать чистоту Ислама.
Ш.Бабаханов был талантливым организатором, при нем было много сделано по реставрации памятников и мечетей, по благоустройству, изданию мусульманской литературы. В 1985 году он возглавил Совет по изданию Священного Корана, осуществленное в Казани.
Муфтий Шамсиддинхан Бабаханов представлял мусульман СССР в ряде всемирных, международных и республиканских организациях - Всемирный Совет Мира, Всемирный Верховный Совет по мечетям, Комитет солидарности стран Азии и Африки, Советский и Узбекский Комитеты Защиты Мира, Советский и Узбекский Фонд Мира, Правления Советского и Узбекского обществ дружбы и культурной связи с зарубежными странами.
Доктор Шамсиддинхан Бабаханов оставил весомое научно-духовное наследие. При его участие и авторстве изданы:
1. Коран (30 глава, перевод) , 1991 г.
2. Известные толкователи хадисов, 1992 г.
3. Фихристы рукописей учения "Накшбандия", 1993 г.
4. Основы мусульманства, 1993 г.
5. Сунмас Зие (Неугасающий свет), 1998 г.
6. Великие мухаддисы о мире и дружбе между народами, 1998 г.
7. Имом Исмоил Ал-Бухори "Жемчужина нравственности", 1990 г.
8. Ислам и мусульмане в стране советов, 1985 г.
9. Муфтий Зияуддинхан ибн Эшон Бабахан:
-на русском языке, 1999 г.
-на узбекском языке, 2001 г.
10. Фихристы литературы и пособий об Амире Тимуре и тимуридах, хранящихся в библиотеках Арабской Республики Египет, Каир 1996 г.
Вместе с тем деятельность Шамсиддинхана Бабаханова проходила в очень сложный перестроечный период конца 80-х годов прошлого века. Несмотря на всю противоречивость того времени, он сумел сделать очень много, исходя из сложившихся обстоятельств, а иногда вопреки им. Высказанные по делу критические замечания Бабаханова об излишней опеке САДУМ со стороны Совета по делам религий при Совете министров СССР, не встретили понимания чиновников, более того, вызвали недовольство и охлаждение отношений, что в конечном счете привело к конфликтной ситуации. Данной ситуацией пытались воспользоваться определенные противоборствующие силы, стремящиеся к власти в САДУМ. Оценив происходящее, во избежание возможных волнений между мусульманами, Шамсиддинхан Бабаханов поступил как мудрый религиозный деятель, последовав указаниям Пророка: "Облегчайте, а не создавайте затруднения, возвещайте благое, а не внушайте отвращение к Исламу" (Имам аль-Бухари), предпочел подать в отставку в феврале 1989 года.
После ухода из САДУМа доктор Шамсиддинхан Бабаханов работает страшим научным сотрудником Института востоковедения имени Абу Райхан Беруни АН Узбекистана. Там его творческая деятельность нашла свое воплощение в научных трудах, статьях и публикациях, изданных как в Узбекистане, так и за рубежом. Большой знаток теории и практики Ислама, он объединил результаты своих многочисленных научных трудов и исследований, в которых были проанализированы труды ученых-богословов и востоковедов, а также отражены сведения о возрождении Ислама в странах Востока, Средней Азии и Казахстана.
С 1994 по 2003 годы на дипломатической работе. Был Чрезвычайным и Полномочным послом Республики Узбекистан в Арабской Республике Египет, Саудовской Аравии, а также по совместительству в Алжире, Бахрейне, Кувейте и Иордании.
За выдающуюся просветительскую деятельность доктор Шамсиддинхан Бабаханов удостоен международной премии имени Абу Али Ибн Сино, награжден орденом СССР "Дружба народов", почетных и памятных наград ряда зарубежных стран, был избран действительным членом Королевской академии Иордании. Ш. Бабаханов ушел из жизни в апреле 2003 г., похоронен в родовом склепе на кладбище "Гойиб-ота" в г. Ташкенте.

Источник: А.Усманходжаев "Жизнь муфтиев Бабахановых: служение возрождению ислама в Советском Союзе". Издательский дом "Медина", Москва-Нижний Новгород, 2008 г.