Родился в городе Баку.

Срочную службу проходил в Прикарпатском военном округе. После окончания службы поступил в Бакинское высшее общевойсковое командное училище, которое окончил с отличием в 1984 году.

Офицерскую службу начал в Группе советских войск в Германии, где служил в должностях от командира взвода до начальника штаба мотострелкового батальона.
Затем проходил службу на Дальнем Востоке, в укрепленном районе на должности начальника штаба отдельного батальона.

После окончания Академии имени Фрунзе в 1993 году по распределению был назначен в Московский военный округ, где прошел должностные ступени командира мотострелкового батальона и начальника штаба танкового полка.

С 1994 по 1996 год исполнял обязанности начальника штаба отдельной мотострелковой бригады на территории Чеченской республики. В феврале 1996 года был назначен командиром мотострелкового полка, который вел боевые действия в Шатойском районе. После принятия решения о выводе войск из Чечни, полк под его командованием покинул территорию республики. В 1997 году полк, которым командовал Сергей Юдин, был первым переформирован в часть постоянной боевой готовности полного состава. А в 1999 году полк под его командованием был переброшен в зону боевых действий на Северный Кавказ.

В 2001 году Сергей Юдин был назначен начальником штаба мотострелковой дивизии в Нижнем Новгороде. Оттуда он поступил в Военную академию Генерального штаба ВС РФ, которую окончил в 2004 году.

06.2004 - 01.2006 - командир 201-й российской военной базы (РВБ), Таджикистан.

С 3.01.2006 - начальник штаба – первый заместитель командующего 2-й гвардейской Краснознаменной армией.

С 11.06.2009 - командующий 20-й гв. Краснознаменной армией, пос. Мулино, Нижегородская обл.

Генерал-майор (06.2005).

награжден орденом "За военные заслуги", двумя орденами Мужества, медалью ордена с мечами "За заслуги перед Отечеством", и 10 медалями.

Женат, два сына.