Родился в городе Караганда.

Окончил в 1973 г. Сибирский автомобильно-дорожный институт им.В. В. Куйбышева в г. Омске; в 1979 г. - университет марксизма-ленинизма при Тюменском обкоме КПСС; в 1988 г. - ВПШ в г. Свердловске (заочно).

С 1967 г. работал настройщиком-регулировщиком радиоаппаратуры Петропавловского радиозавода им. Кирова в Казахстане.

1968 - 1973 гг. - студент Сибирского автомобильно-дорожного института, г. Омск.

1973 - 1977 гг. - инженер производственно- технического отдела, строймастер, старший инженер ПТО Мостопоезда № 442 Минтрансстроя СССР, г. Сургут.

1977 - 1982 гг. - инструктор, зав. отделом строительства Ханты-Мансийского окружкома КПСС.

1982 - 1991 гг. - работа в партийных органах округа.

1991 - 1995 гг. - глава администрации ХМАО.

1995 г. - губернатор Ханты-Мансийского автономного округа.

1996 г. - избран губернатором Ханты-Мансийского автономного округа, в 2000 году переизбран на второй срок.

24 февраля 2005 г. - по представлению президента РФ Владимира Путина Филипенко утвержден Думой Югры в должности губернатора.