Род. в городе Иссык Енбекшиказахского района Алматинской области.

В 1998 году окончил Алматинский институт энергетики и связи по специальности "экономика и менеджмент в отраслях топливно-энергетического комплекса".

Трудовую деятельность начал в январе 1998 года в ОАО "Казахстанская компания по управлению электрическими сетями "КЕGOC". В январе 2005 года перешел на государственную службу директором департамента по регулированию и контролю в сфере электро- и теплоэнергетики Агентства Республики Казахстан по регулированию естественных монополий.
С 17 февраля 2010-2013 - заместитель председателя Агентства Республики Казахстан по регулированию естественных монополий.
В 2013-2014 - председателем правления АО "Казахстанский центр модернизации и развития ЖКХ".
В нояб. 2014 - мае 2017 - аким гор. Сарань Карагандинской обл.
В мае 2017 - 2018 - зам. акима Карагандинской обл. /курирует вопросы ЖКХ, ЧС и энергетики/.

В 10.2018 - 11.2018 - вице-министр энергетики РК

7.11.2018 г. на заседании СовБеза РК Генеральный прокурор Казахстана Кайрат Кожамжаров обвинил вице-министра энергетики Анатолия Шкарупу в хищении средств -
"Серьезные претензии со стороны закона имеются к недавно назначенному вице-министру Анатолию Шкарупе, бывшему акиму Сарани (Карагандинская область - прим.). Он причастен к хищению 215 миллионов тенге, выделенных в 2015 году на установку приборов учета в Сарани, где вообще нет центрального отопления", - сказал Кожамжаров на заседании Совета Безопасности в Акорде. По его словам, счетчики монтировались на пустые стены. По данному факту начато расследование.
19.11.2018 СМИ РК сообщили об его задержании и аресте.
Содержится в следственном изоляторе АК 159/1, вменяется статья 189 часть 4 пункт 2 УК РК (Присвоение или растрата вверенного чужого имущества в группе лиц в особо крупном размере).
В 06.2020 выпущен Карагандинским судом под домашний арест. 25.01.2021 решением Казыбекбийского районного суда Караганды полностью оправдан.