Родился в селе Урюпинка Алексеевского района Целиноградской области (Казахская ССР).

Окончил среднюю школу в 1975 году.

С 1976-го по 1978 год проходил службу в ракетных войсках в городе Горьком. В 1978 году вернулся в родное село, некоторое время проработал нормировщиком в машинно-тракторной мастерской. В 1979 году поступил на транспортно-дорожный факультет Карагандинского политехнического института, который окончил в 1985 году по специальности "Автомобили и автомобильное хозяйство". В 1986 году переехал в город Степногорск, где работал в институте биологической промышленности начальником транспортного цеха. Позже перешел главным инженером подсобного хозяйства на завод "Прогресс", обеспечивавший институт биологически активными веществами и химическими препаратами. С 1988-го по 1990-й работал в Степногорском управлении строительства - вначале механиком управления механизированных работ, а затем начальником участка. В 1990 году перешел механиком участка на Целинный горнохимический комбинат. Позже стал заместителем председателя производственного строительно-монтажного кооператива "Горный", который занимался строительством жилья и промышленных объектов. В 1992 году поступил на работу в должности начальника производства в коммерческую фирму "Норд-Казахстан", занимавшуюся реконструкцией завода "Целиноградсельмаш" в городе Целинограде. В 1996 году, в связи с окончанием работ по реконструкции завода, был вынужден вернуться в Степногорск, где до 1998 года работал механиком в ГУП "Каззолото". В 1998 году переехал в Омск, работал начальником производства и одновременно главным инженером на Омском комбикормовом заводе, который к тому времени находился на балансе зональной опытной станции по птицеводству. В 2001 году завод был переведен в областную собственность, а Сергей БОЙКО распоряжением губернатора был назначен его директором. За год ОГУП "Омский комбикормовый завод" был выведен на уровень рентабельности за счет перепрофилирования деятельности: выпуск комбикормов был сокращен, а элеватор и складские помещения использовались для оказания сельхозпроизводителям услуг по приемке, хранению и отгрузке зерна.

С 1 января 2002 года возглавляет Морозовскую птицефабрику (экспериментальное племенное хозяйство Сибирского НИИ птицеводства).

директор организации научного обслуживания экспериментального племенного хозяйства Сибирского НИИ птицеводства.

Женат, двое детей.