Родился в д. Афонино Переславльского района Ярославской обл.

В 1974-1978 г. окончил техникум химической промышленности, г. Переяславль-Залесский

работал водителем в в Переславском химическом заводе и в переславской "Сельхозхимии".
В 1981 г. поступил в Московскую духовную семинарию, в 1985 г. – в Московскую духовную академию, которую окончил в 1989 г. со степенью кандидата богословия.

16 июня 1987 года пострижен в монашество с именем Анатолий в честь преподобного Анатолия Киево-Печерского.

С августа 1989 г. преподаватель МДАиС, профессорский стипендиат 1989/90 учебного года.
С сентября 1990 по апрель 1994 г. исполнял послушание старшего помощника инспектора МДАиС, с ноября 1990 г. заместитель ректора по административно хозяйственной работе.
16 июня 1987 г. принял монашеский постриг, 28 июня рукоположен во иеродиакона, 18 июля – во иеромонаха, 10 апреля 1990 г. возведен в сан игумена.
22 января 1994 г. назначен наместником Никитского и Данилова монастырей в Переславль-Залесске и строителем Переславль-Залесского Никольского женского монастыря. 7 апреля 1995 г. возведен в сан архимандрита.
15 февраля 1998 г. был хиротонисан во епископа Переславль-Залесского, викария Ярославской епархии. С марта по декабрь 1998 г. являлся ректором Ярославского духовного училища.
28 декабря 1998 г. переведен на Магаданскую кафедру.
С 8 октября 2000 г. епископ Ялуторовский, викарий Тобольской епархии.
17 июля 2001 г. почислен на покой /"за самовольное оставление в декабре 2000 года места служения"/
В 2002 году в селе Ефимьево Переславского района основал приют для престарелых, инвалидов и беспомощных людей АНО "Божедомье":

С 6 окт. 2010 - епископ Костанайский и Петропавловский (с 5 окт. 2011 - Костанайский и Рудненский) Русской Православной Церкви в Казахстане
+ с 25 марта 2011 года решением Синода Митрополичьего округа в Республике Казахстан назначен председателем хозяйственного управление Казахстанского митрополичьего округ

25 авг. 2020 решением Св. Синода РПЦ отрешен от должности
"В связи с долговременным отсутствием в епархии, приведшим к серьезным недочетам в ее управлении, освободить Преосвященного епископа Костанайского и Рудненского Анатолия от управления Костанайской епархией и почислить его на покой, определив ему пребывать на покое под наблюдением Преосвященного наместника Свято-Троицкой Сергиевой лавры".

Награды
2013 г. - Орден святителя Иннокентия Московского III степени;
2013 г. - Орден "За заслуги перед Православной Церковью Казахстана".
2018 г. - "Орден Священомученика Пимена Верненского" (Митрополичий округ в Казахстане);
2018 г. - Орден Преподобного Серафима Саровского III степени;
Медаль преподобного Сергия Радонежского I степени.