Родилась в Душанбе в семье известных ученых-востоковедов. За короткий период своей жизни она внесла большой вклад в развитие науки Таджикистана. М. Бакоева с отличием окончила факультет математики Таджикского национального университета, защитила кандидатскую диссертацию по физико-математическим наукам.

Последние несколько лет Манижа Бакоева проживала в Москве, где продолжила свою научную деятельность.

Умерла в Москве