Род. в д. Хорамал Урмарского района Чувашии. Чуваш.

В русской армии с 1915г., подпоручик. В Красной Армии с 1919г.

Окончил Чистопольскую школу/прапорщиков (1916), Военную академию им. М.В. Фрунзе (1932), Академию Генштаба (1937). Участник Первой мировой войны на Западном фронте.

В годы Гражданской войны воевал на Южном фронте и против повстанцев на Кубани, командир роты, адъютант штаба стрелкового полка. В межвоенный период помощник начальника и начальник штаба стрелкового полка, помощник начальника сектора, 2-го отдела и 2-го отделения 1-го управления штаба РККА. С 1937 г. начальник 1-го отдела, с октября 1940 г. - заместитель начальника штаба - начальник оперативного отдела штаба Среднеазиатского военного округа.

С начала Великой Отечественной войны М.Ф. Липатов на прежней должности. В Великой Отечественной войне в должности начальника оперативного отдела 53-й армии участвовал в операции по вводу советских войск в Иран. С января 1942 г. началь¬ник штаба Среднеазиатского военного округа. В 1943 г. в порядке изучения опыта войны был направлен на Калининский фронт. В сентябре 1943 г. осужден военным трибуналом условно на 3 года за слабую организацию контроля за хранением боеприпасов. Судимость с М.Ф. Липатова снята в июле 1944 г., и он был назначен врид командующего войсками Среднеазиатского военного округа, на территории которого было сформировано большое количество частей и соединений для действующей армии.

После войны с мая по июль 1945 г. М.Ф. Липатов начальник штаба Туркестанского военного округа, затем старший препода¬ватель кафедр тактики высших соединений и оперативного искусства Высшей военной академии им. К.Е. Ворошилова. С авгус¬та 1959 г. в отставке.

Награжден орденом Ленина, 2 орденами Красного Знамени, медалями.

Генерал-майор (1940).

Умер в г. Москва.