Бандишоев родился в 1959 году, окончил Московский государственный университет им. М. Ломоносова по специальности "юриспруденция".

С 1987 по 2007 годы занимал различные должности в прокуратуре Таджикистана, от старшего следователя до прокурора Канибадама.

С 2007 по 2015 годы работал в Агентстве по финансовому контролю и противодействию коррупции от должности руководителя агентства в Согдийской области до заместителя председателя агентства.

В июне 2011 года генерал Бандишоев был назначен заместителем председателя Агентства по борьбе с коррупцией Таджикистана и занимал эту должность до февраля 2015 года.

В 2015 году он вернулся в прокуратуру, где еще два года был заместителем начальника Управления по расследованию особо важных дел.

Два года назад Бандишоев назначен заместителем прокурора Хатлонской области, а в 2013-м приказом ему присвоено звание генерал-майора.

7 окт 2020 в Таджикистане от пневмонии скончался 61-летний экс-заместитель председателя Агентства по борьбе с коррупцией республики генерал-майор Миллопар Бандишоев. У 61-летнего генерал-майора диагностировали пневмонию.