Родился 8 декабря 1947 года в пос. Медвежка Кемеровской области в семье геолога Сергея Алексеевича Худякова (1919-1984) и художницы Ирмгардт Амалии Геккер, уроженки США (ее отец - Юлий Геккер (1881-1938) - в юности участвовал в революционной деятельности и эмигрировал из России, опасаясь преследования властей, впоследствии стал известным философом и вернулся в СССР по приглашению Луначарского, перевезя и семью).

Окончил гуманитарный факультет Новосибирского государственного университета (1974).
В 1977 г. защитил кандидатскую диссертацию (научный руководитель академик А. П. Окладников, затем А. П. Деревянко).
В 1988 г. защитил докторскую диссертацию.
Главный научный сотрудник Института археологии и этнографии СО РАН, заведующий кафедрой археологии и этнографии НГУ.
Скончался 24 декабря 2021 года на 75-м году жизни от последствий, вызванных коронавирусной инфекцией.

Научная школа
Специалист в области оружиеведения, кыргызоведения, военной и этнокультурной истории древних и средневековых кочевников Южной Сибири и Центральной Азии. Проводил археологические исследования на территории Южной Сибири, в Киргизии и Таджикистане. Участвовал в международных экспедициях в Монголию, Китай, Саяно-Алтай, Среднюю Азию.
Среди его учеников - двое археологов из Кыргызстана, кандидаты исторических наук Кубатбек Табалдиев и Ороз Солтобаев.

Награды
орден "Манас" III степени Кыргызской Республики (31.12.2016).
орден "Данакер" Кыргызской Республики (2002).
заслуженный деятель науки Кыргызской Республики (2004).
почетный профессор Кыргызского национального университета имени Жусупа Баласагына.
почетный профессор Института восточных языков и культур Кыргызской Республики при Кыргызском государственном университете имени И.Арабаева.
член международного института кочевых цивилизаций ЮНЕСКО в Монголии.
лауреат премии им. акад. А. Алтымышбаева и премии им. чл.-кор. А. Табалдиева.