Премьер-министр
Абдумалик Абдулладжанов
Яхъе Азимов (?-20.12.1999)
Акил Акилов (с 20.12.1999).

Первый вице-премьер
Ходжи-Акбар Тураджонзода

Вице-премьеры:
Абдурахмон Азимов (?-12.1999); Сайдамир Зухуров (12.1999-10.01.2005) (курирует силовой блок) ;
Нигина Шаропова (12.1999-19.01.2004); Хайриниссо Мавлонова
Закир Вазиров (курирует социальный блок) (12.1999-3.02.2005).
Козидавлат Коимдодов (курирует аграрный сектор) (до 5 января 2005).
Фаридун Мухиддинов (?-12.2002); Асадулло Гуломов (курирует вопросы ТЭК) (с января 2003)

Министр иностранных дел
Талбак Назаров

Министр безопасности
Хайриддин Абдурахимов

Министр обороны
Шерали Хайруллаев

Министр внутренних дел
Хумдин Шарипов (с 31 октября 1996)

Министр по чрезвычайным ситуациям и гражданской обороны
Мирзо Зиеев

Министр по государственным налогам и сборам (создано в январе 2002 путем объединения Таможенного и Налогового комитетов).
Гуломджон Бабаев

Министр здравоохранения
Аламхон Ахмедов (до 18.01.2003); Нусратулло Файзуллоев (с 18 января 2003)

Министр культуры
Кароматулло Олимов (до 6.01.2004); Раджабмад Амиров (с 6.01.2004).

Министр мелиорации и водного хозяйства
Абдукохир Назиров

Министр образования
Сафарали Раджабов

Министр промышленности
Зайд Саидов

Министр сельского хозяйства
Турсунбой Рахматов (до 6.01.2004); Ворис Самиевич Мадаминов (с 6.01.2004).

Министр связи
Нуруддин Мухитдинов (до 18.01. 2003), Саид Зувайдов (с 18 января 2003).

Министр труда и социальной защиты населения
Рафика Мусаева (до 31.01.2003); Мамадшо Илолов (17.02.2003-03.02.2005); Закир Вазиров (с 3.02.2005).

Министр транспорта и дорожного хозяйства
Абдуджалол Салимов

Министр финансов
Сафарали Наджмуддинов

Министр экономики и торговли
Хаким Солиев

Министр энергетики
Абдулло Еров (до 19.01.2004); Джурабек Нурмахматов (19.01.2004-24.04.2006); Абдулло Еров (с 24.04.2006)

Министр юстиции
Халифабобо Хамидов

Министр охраны природы (расформировано в январе 2004).
Шокиров Усмонкул (до 19.01.2004)

НЕ ВХОДЯТ В СОСТАВ ПРАВИТЕЛЬСТВА -

Комитет по охране государственной границы при правительстве страны
Государственный Комитет по охране государственной границы при правительстве страны (с 01.2006).
Абдурахмон Азимов (2002-10.01.2005); Сайдамир Зухуров (с 10.01.2005).

Государственный Комитет строительства и архитектуры (образован в январе 2003).
Матлуба Халифаева (с января 2003)

Председатель Конституционного Суда
Мамадназар Салихов (до 18.01.2003); Зариф Алиев (с 18.01.2003)

Председатель Совета юстиции
Мизроб Кабиров (до 18.01.2003); Мамадназар Салихов (с 18.01.2003)

Председатель Комитета по делам религий при Правительстве РТ
Саид Ахмадов

Государственный Комитет охраны окружающей среды и лесного хозяйства РТ (образован в январе 2004).
Каримов Абдувохид Екубович - пред. (с 19.01.2004)

Комитет статистики РТ
Одилжон Джаборов (до 19.01.2004); Муним Холиков (с 19.01.2004).

Комитет по телевидению и радиовещанию при Правительстве РТ
Убайдулло Раджабов (июль 2000-19.01.2004); Абдуджаббор Рахмонов - пред. (с 19.01.2004)

Государственный советник Президента по социальному развитию и связям с общественностью
Ибрагим Кенджаевич Усманов (до 6.01.2004); Караматулло Олимов (с 6.01.2004).

Комитет по физической культуре и спорту при Правительстве Республики Таджикистан
Абдулвахидов Сулаймон (с 12.02.2004).

Агентство по контролю за наркотиками при Президенте РТ.
Рустам Назаров (3 июня 1999 - 30 января 2004), Гаффор Мирзоев (с 30.01.2004).