Структура утверждена Собранием народных представителей
Жогорку Кенеша Кыргызской Республики 6 февраля 2004 года

Премьер-министр
ТАНАЕВ Николай

Первый вице-премьер - министр транспорта и коммуникаций
ЖУМАЛИЕВ Кубанычбек - и.о. с 7.02.2004, министр с 30.03.2004

Вице-премьер /курирует социальную сферу/
МАТЕЕВ Уларбек - и.о. с 7.02.2004, вице-премьер с 30.03.2004-07.2004; АЙТИКЕЕВА Токтобюбю - и.о. с 09.2004, вице-премьер с 24.12.2004-

Вице-премьер
ОТОРБАЕВ Джоомарт

Министерство внутренних дел Кыргызской Республики
СУБАНБЕКОВ Бакирдин Жамалдинович

Министерство здравоохранения Кыргызской Республики

Министерство иностранных дел Кыргызской Республики
АЙТМАТОВ Аскар Чингизович

Министерство обороны Кыргызской Республики
ТОПОЕВ Эсен Толенович

Министерство образования Кыргызской Республики
БОЛДЖУРОВА Ишенгуль - и.о. министра (с 7.02.-20.03. 2004)
КИДИБАЕВ Мустафа Мусаевич - и.о. с 26.03.2004, министр с 30.03.2004

Министерство сельского, водного хозяйства и перерабатывающей промышленности Кыргызской Республики

Министерство труда и социальной защиты Кыргызской Республики

Министерство финансов Кыргызской Республики
АБИЛДАЕВ Болот Eралханович

Министерство экологии и чрезвычайных ситуаций Кыргызской Республики

Министерство экономического развития, промышленности и торговли Кыргызской Республики
МУРАЛИЕВ Амангельды - и.о. с 7.02.2004, министр с 10.07.2004.

Министерство юстиции Кыргызской Республики
БЕЙШЕНАЛИЕВА Неля - и.о. (в 7.02.-

Министерство по делам международной интеграции и сотрудничества
(образовано 1.04.2004)
ШАБОЛОТОВ Тажимамат Тайгериевич - и.о. с 1.04.2004, министр с 10.07.2004.

Государственный комитет Кыргызской Республики по туризму, спорту и молодежной политике

Государственный комитет Кыргызской Республики по управлению государственным имуществом
ЖЕЕНБЕКОВ Рафшан - и.о. пред. с 7.02.2004, пред. с 30.03.2004.

Другие государственные органы -

Администрация Президента

КАСЫМОВ Тойчубек -руководитель (с 7.02.2004).
ДЖАНУЗАКОВ Болот Чыныбаевич - первый заместитель Руководителя Администрации Президента Кыргызской Республики – заведующий отделом организационной работы и политики государственного управления (с 6.02.2004)
ДШЕКШЕНКУЛОВ Аликбек - заместитель Руководителя Администрации Президента Кыргызской Республики – заведующий отделом внешней политики (с 6.02.2004)

Государственное агентство РК по энергетике при Правительстве Кыргызской Республики.
УЗАКБАЕВ Эмиль - пред. (6.02.-26.04.2004).
АВАЗОВ Салайдин Абдивалиевич - пред. (с 26.04.2004).

Государственное агентство РК по регистрации прав на недвижимое имущество при Правительстве Кыргызской Республики.
КАРАЧАЛОВ Кенешбека Касымовича - пред. с 7.02.2004

Агентство КР по делам государственной службы (образовано в сентябре 2004 г.).
ДЖУМАБАЕВ Акылбек Усенкулович - и.о. директора (с 5.10.2004), директор с 24.12.2004.
Джамакеева Санаткуль Дуйшеновна - и.о. статс-секретарь агентства (с 5.10.2004).

Верховный Суд КР
ОСМОНОВ Курманбек - пред. (с 6.02.2004).

Совет безопасности
АШЫРКУЛОВ Мисир - секретарь (с 7.03.2001).

Специальный представитель Президента КР по привлечению инвестиций
ДЖИЕНБЕКОВ Садриддина Мухидовича - с 7.02.2004.

Счетная палата КР
ОСКОМБАЕВ Дамир Абдыкеримович - и.о. пред. с 7.03.2004, пред. с 30.03.2004.

Национальный институт стандартов и метрологии Кыргызской Республики
ДАВЛЕСОВ Батырбек Насырович - директор с 7.02.2004